Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28077-201ENSMUST00000190250 1635 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11483-201ENSMUST00000119839 247 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 B430319H21Rik-201ENSMUST00000123420 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20540-201ENSMUST00000172972 799 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28709-201ENSMUST00000186967 456 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29343-201ENSMUST00000187887 842 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1225-201ENSMUST00000188861 1027 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38261-201ENSMUST00000192608 316 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5851-201ENSMUST00000194132 1204 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45323-201ENSMUST00000209853 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 1700011B04Rik-211ENSMUST00000222690 394 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Psors1c2-201ENSMUST00000025273 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Cox7b2-201ENSMUST00000050129 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r80-201ENSMUST00000075053 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Mrps31-201ENSMUST00000033934 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 AC133934.1-201ENSMUST00000223052 1761 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 A430073D23Rik-201ENSMUST00000196262 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18691-201ENSMUST00000203593 872 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr120-201ENSMUST00000077498 993 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr935-201ENSMUST00000080748 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms