Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gm9531-201ENSMUST00000055820 638 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Mfsd4a-201ENSMUST00000046658 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Pfkfb3-215ENSMUST00000183869 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Efna1-201ENSMUST00000029566 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Gm12927-201ENSMUST00000150252 373 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Nmb-201ENSMUST00000026817 705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Mblac2-201ENSMUST00000057598 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Gm19557-201ENSMUST00000182109 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.3 ms