Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm43305-202ENSMUST00000225083 705 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Pigr-201ENSMUST00000027675 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Zfp185-203ENSMUST00000164800 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Syt11-201ENSMUST00000090945 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm42856-201ENSMUST00000200848 2852 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gucy2d-201ENSMUST00000098274 3537 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm15128-201ENSMUST00000112814 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Pus7-206ENSMUST00000148618 3266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Zfp661-203ENSMUST00000110368 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Poteg-201ENSMUST00000081321 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Slc38a2-201ENSMUST00000023099 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 AC154575.1-201ENSMUST00000227166 1474 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Sh3bgrl2-204ENSMUST00000188241 3155 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 AC110091.2-201ENSMUST00000215107 1512 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm19144-201ENSMUST00000221921 1859 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Mirg-204ENSMUST00000182185 3822 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm37976-201ENSMUST00000193827 345 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm35608-201ENSMUST00000218472 2370 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Atp2a1-201ENSMUST00000032974 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Ncoa7-209ENSMUST00000216172 2026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm16551-203ENSMUST00000160979 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm21026-201ENSMUST00000218628 1345 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Cenpi-201ENSMUST00000081064 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Sltm-201ENSMUST00000049263 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Nek10-202ENSMUST00000112630 3348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gimap4-201ENSMUST00000067506 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 1700019C18Rik-203ENSMUST00000222085 1766 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Ppp1r12a-201ENSMUST00000070663 3403 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Elmo1-201ENSMUST00000072519 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Csf3r-202ENSMUST00000106162 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Polr1b-202ENSMUST00000103205 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Fmr1-202ENSMUST00000114653 4058 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 4933431E20Rik-210ENSMUST00000152663 2358 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 5430427N15Rik-201ENSMUST00000200007 2393 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm37178-201ENSMUST00000194962 1539 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Xdh-201ENSMUST00000024866 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Abcc3-206ENSMUST00000178136 5005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm43532-201ENSMUST00000199389 3816 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Siglech-203ENSMUST00000121492 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Rpap3-ps2-201ENSMUST00000184741 2161 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Ppp6c-201ENSMUST00000028087 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Olfr1424-202ENSMUST00000207681 1714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 AC132412.1-201ENSMUST00000204155 2724 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Cep57l1-205ENSMUST00000187143 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm7516-201ENSMUST00000186198 706 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms