Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 A430072C10Rik-201ENSMUST00000197848 2532 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Atp4a-201ENSMUST00000005692 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Zfp958-202ENSMUST00000202692 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm38245-201ENSMUST00000191702 2621 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm37843-201ENSMUST00000195213 2639 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Atg7-201ENSMUST00000032457 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sh3bp1P55194 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm32552-201ENSMUST00000217849 2291 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sh3bp1P55194 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sh3bp1P55194 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 BC005624-201ENSMUST00000028205 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Slc28a2-202ENSMUST00000110524 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Olfr825-203ENSMUST00000216530 3502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Trim69-201ENSMUST00000036089 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Pde1c-204ENSMUST00000164752 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Pla2g4e-201ENSMUST00000090071 4477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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