Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Fermt1-201ENSMUST00000038280 4915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Prrg3-201ENSMUST00000048790 5931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms