Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Xpo7-201ENSMUST00000022696 4472 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Snd1-206ENSMUST00000167201 3781 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Rest-201ENSMUST00000080359 7004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Tmem131l-203ENSMUST00000192095 4774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Stx8-201ENSMUST00000021285 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Copa-206ENSMUST00000135192 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gm37048-201ENSMUST00000194827 5578 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Ncoa3-201ENSMUST00000088095 7531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Ephb4-202ENSMUST00000111054 3784 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Pms2-209ENSMUST00000148011 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms