Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Olfr804-202ENSMUST00000213331 5737 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Tbck-202ENSMUST00000169172 6578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Serpinc1-201ENSMUST00000064725 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Myrf-205ENSMUST00000189897 3339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Elavl1-204ENSMUST00000209010 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Nod2-203ENSMUST00000118370 4653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Adra1a-203ENSMUST00000159365 4118 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Tmem63c-203ENSMUST00000146292 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm11988-201ENSMUST00000122321 1069 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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Pou4f1P17208 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Pou4f1P17208 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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Pou4f1P17208 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Zfp462-201ENSMUST00000030131 4823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Tnfrsf9-204ENSMUST00000105672 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Bcl9-207ENSMUST00000166341 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Itgam-207ENSMUST00000098015 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms