Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Mfsd4a-201ENSMUST00000046658 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Napepld-202ENSMUST00000115217 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Fam13c-203ENSMUST00000173042 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Eno2-202ENSMUST00000112476 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Rrh-202ENSMUST00000171313 1759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Serpina3m-201ENSMUST00000101078 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Serpina3m-202ENSMUST00000168797 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Sun1-201ENSMUST00000058716 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Ighv8-6-201ENSMUST00000103524 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Ins2-202ENSMUST00000105930 583 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm14174-201ENSMUST00000153158 161 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Igkv4-54-201ENSMUST00000177697 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm5905-201ENSMUST00000211731 580 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm7344-201ENSMUST00000212122 1222 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 AC166165.1-201ENSMUST00000214352 874 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Zc3h7a-201ENSMUST00000037633 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Opalin-201ENSMUST00000087176 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Ispd-206ENSMUST00000223068 2808 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Pus7l-201ENSMUST00000049151 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 AC117245.3-201ENSMUST00000217495 2176 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 4930429F24Rik-201ENSMUST00000151676 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Zfp386-201ENSMUST00000073551 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm37484-201ENSMUST00000195378 2523 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Diaph1-201ENSMUST00000025337 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Fam171a1-202ENSMUST00000072955 3364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Mblac2-201ENSMUST00000057598 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Bcl9-207ENSMUST00000166341 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Pik3r3-202ENSMUST00000106490 1830 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Ssb-206ENSMUST00000166411 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Vma21-201ENSMUST00000114575 4290 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms