Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 5330411J11Rik-201ENSMUST00000137162 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm2237-201ENSMUST00000112595 471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Coa4-202ENSMUST00000120454 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm11295-201ENSMUST00000121379 803 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm14715-201ENSMUST00000156823 643 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm17147-201ENSMUST00000164176 432 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm26611-201ENSMUST00000181449 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 1500002F19Rik-203ENSMUST00000211184 375 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Speer2-201ENSMUST00000076500 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Hspa12b-202ENSMUST00000100763 628 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm24161-201ENSMUST00000104592 130 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm23908-201ENSMUST00000104599 132 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm12240-201ENSMUST00000120178 229 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm2328-201ENSMUST00000193525 535 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 2010008C14Rik-201ENSMUST00000203956 593 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm29328-212ENSMUST00000209182 1168 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm7790-201ENSMUST00000118716 1310 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 4933405D12Rik-201ENSMUST00000180557 1383 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms