Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Vmn1r-ps132-201ENSMUST00000120434 892 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 2610016A17Rik-203ENSMUST00000188711 515 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 5031425E22Rik-205ENSMUST00000191186 719 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm2788-205ENSMUST00000209849 933 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Olfr1453-201ENSMUST00000087773 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Xlr5a-203ENSMUST00000114521 1474 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 5830473C10Rik-202ENSMUST00000200765 1691 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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SrfQ9JM73 Bcas1os2-201ENSMUST00000131931 1174 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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SrfQ9JM73 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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SrfQ9JM73 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm8952-201ENSMUST00000206828 1102 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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