Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms