Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS8

Small membrane A-kinase anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPS8 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CPS8 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Rian-213ENSMUST00000182981 1219 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Gm37976-201ENSMUST00000193827 345 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CPS8 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Acsl6-203ENSMUST00000072178 2432 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Atg9a-201ENSMUST00000040689 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Ubap2-201ENSMUST00000030143 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Gm45336-201ENSMUST00000210010 3230 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Gm44570-201ENSMUST00000207526 3698 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Galnt1-201ENSMUST00000000430 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Adora3-201ENSMUST00000000574 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Rnf13-201ENSMUST00000041826 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Sh3kbp1-204ENSMUST00000112451 3914 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Osbpl5-202ENSMUST00000119499 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Wdr78-202ENSMUST00000036557 3479 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Gm44629-201ENSMUST00000206951 1840 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 AC123534.1-202ENSMUST00000224256 1837 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 4930429F24Rik-201ENSMUST00000151676 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 AC110091.2-201ENSMUST00000215107 1512 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Brcc3-201ENSMUST00000033544 4310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Gm14372-201ENSMUST00000125355 2193 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Pla2g2d-201ENSMUST00000030528 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Ilf3-204ENSMUST00000213603 3430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Kcnj5-202ENSMUST00000214223 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Baiap3-201ENSMUST00000169109 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Kctd7-201ENSMUST00000040616 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 1700012J15Rik-201ENSMUST00000203458 471 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Tmem87a-201ENSMUST00000090042 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Kcnmb1-201ENSMUST00000020362 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Pigq-202ENSMUST00000097368 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 P2ry14-202ENSMUST00000091112 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Rassf5-202ENSMUST00000068564 3076 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 March1-206ENSMUST00000110256 3288 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Mc3r-201ENSMUST00000038532 2623 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Zfp386-201ENSMUST00000073551 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Plcd4-201ENSMUST00000027362 2977 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Fcgr3-204ENSMUST00000169017 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Mgat4a-202ENSMUST00000143636 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 AC159819.3-201ENSMUST00000216940 1837 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Gm13140-201ENSMUST00000119840 3151 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Gtf2i-223ENSMUST00000174513 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Dock7-201ENSMUST00000030286 7127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q9CPS8 AC104200.1-201ENSMUST00000224527 1746 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q9CPS8 Drc3-204ENSMUST00000108723 1917 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms