Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Pfkfb3-215ENSMUST00000183869 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Gm12737-201ENSMUST00000142835 725 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Babam2-201ENSMUST00000063813 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Plbd1-201ENSMUST00000032336 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Gm19557-201ENSMUST00000182109 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Ephb4-202ENSMUST00000111054 3784 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Usp16Q99LG0 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Ighv8-6-201ENSMUST00000103524 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Gm15602-201ENSMUST00000116162 465 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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Usp16Q99LG0 Gm12927-201ENSMUST00000150252 373 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Usp16Q99LG0 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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Usp16Q99LG0 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Zfp74-204ENSMUST00000108212 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Gsg1-204ENSMUST00000111911 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Harbi1-201ENSMUST00000090608 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Masp2-202ENSMUST00000105701 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms