Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm9979-201ENSMUST00000069457 3005 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Uhrf1-204ENSMUST00000113039 3391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Tsr2-202ENSMUST00000112683 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Atg14-201ENSMUST00000042988 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Gpatch4-201ENSMUST00000029707 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Ubap2-201ENSMUST00000030143 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Gm42460-201ENSMUST00000198863 2567 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Ccdc40-202ENSMUST00000053440 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Fkbp15-201ENSMUST00000084527 4264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Zfp60-208ENSMUST00000167955 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Lamp2-202ENSMUST00000061755 3604 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Nrxn1-225ENSMUST00000197268 2280 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 1700010I14Rik-203ENSMUST00000151609 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Car12-201ENSMUST00000071889 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Pde4d-209ENSMUST00000122041 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Ptgds-201ENSMUST00000015234 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Mmrn2-201ENSMUST00000111908 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 3632454L22Rik-202ENSMUST00000153610 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Nupl1-202ENSMUST00000041905 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Rac2-201ENSMUST00000043214 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d14-203ENSMUST00000126077 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Gtpbp10-202ENSMUST00000115441 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Dgcr2-204ENSMUST00000117945 4003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Unc13d-209ENSMUST00000174822 3337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Gm37032-201ENSMUST00000194882 2975 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Proser3-201ENSMUST00000062708 1905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Glb1l2-202ENSMUST00000066560 3688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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