Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 1700001J04Rik-202ENSMUST00000154037 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Myl6-201ENSMUST00000164181 665 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 CAAA01139602.1-201ENSMUST00000222545 283 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Pde4d-202ENSMUST00000079975 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm3712-201ENSMUST00000118523 2071 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Blnk-201ENSMUST00000054769 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Xlr3a-201ENSMUST00000074619 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Odf2-205ENSMUST00000113757 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Cd200r2-201ENSMUST00000102805 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Acta2-201ENSMUST00000039631 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 5330439K02Rik-201ENSMUST00000180953 2312 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm38413-202ENSMUST00000198449 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm16033-201ENSMUST00000144915 596 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm37141-201ENSMUST00000191938 422 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Hmgb4-201ENSMUST00000053830 746 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Pcdh15-221ENSMUST00000146682 1891 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 4932702P03Rik-202ENSMUST00000151220 2792 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Slc35f6-201ENSMUST00000062962 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Hspd1-ps4-201ENSMUST00000121815 1668 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm28578-203ENSMUST00000189196 1470 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Osbpl1a-204ENSMUST00000119043 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Samsn1-201ENSMUST00000114239 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms