Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Bpifb2-201ENSMUST00000028983 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Cd300lb-203ENSMUST00000149663 2641 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Zcchc12-203ENSMUST00000115257 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Krba1-208ENSMUST00000203371 4000 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Rfx6-202ENSMUST00000122922 3464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Smc2-201ENSMUST00000102915 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Klhl1-201ENSMUST00000022666 6645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc40-202ENSMUST00000053440 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm5130-201ENSMUST00000210233 959 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Hmgb4-201ENSMUST00000053830 746 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 A430093F15Rik-201ENSMUST00000087947 985 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Ankdd1b-201ENSMUST00000055607 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Nnt-206ENSMUST00000223268 3339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Csf2rb-201ENSMUST00000096355 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm13498-201ENSMUST00000119159 2166 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Tomt-201ENSMUST00000106969 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Papss1-206ENSMUST00000200527 2811 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Dusp27-201ENSMUST00000085992 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Mef2a-208ENSMUST00000156690 5538 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Anapc1-201ENSMUST00000014499 8942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Fubp1-220ENSMUST00000200524 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Herc3-202ENSMUST00000041401 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm26601-201ENSMUST00000181427 3551 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Has3-201ENSMUST00000034385 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Zfp275-202ENSMUST00000114499 6284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Svep1-201ENSMUST00000042850 11629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Prdx3-201ENSMUST00000025961 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Col4a5-202ENSMUST00000112931 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Olfr15-203ENSMUST00000214590 6240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Il6st-209ENSMUST00000184445 1870 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Dnajb13-204ENSMUST00000207405 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Hmgcs2-201ENSMUST00000090746 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 A730018C14Rik-201ENSMUST00000050754 2253 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Aqp4-201ENSMUST00000079081 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Dysf-203ENSMUST00000113818 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Nrxn3-203ENSMUST00000110133 2699 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Trmt13-201ENSMUST00000041524 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm5266-201ENSMUST00000187302 1162 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.9 ms