Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Mthfd1-206ENSMUST00000220046 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm10804-201ENSMUST00000099693 2244 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm44926-201ENSMUST00000207898 1826 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Arhgap36-201ENSMUST00000042444 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm37759-201ENSMUST00000194155 3246 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Galns-201ENSMUST00000015171 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Rac2-201ENSMUST00000043214 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Plekhb2-201ENSMUST00000027297 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Npas4-201ENSMUST00000056129 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Kng1-202ENSMUST00000039492 1985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Far1-211ENSMUST00000164745 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Mfsd11-201ENSMUST00000021173 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Snd1-206ENSMUST00000167201 3781 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Ctage5-201ENSMUST00000021384 1628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Fam171a1-202ENSMUST00000072955 3364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm9978-201ENSMUST00000069431 3273 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 D3Ertd751e-201ENSMUST00000026867 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm10857-201ENSMUST00000195343 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Plk4-201ENSMUST00000026858 3479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Sept6-202ENSMUST00000060474 3457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Slc22a21-201ENSMUST00000076493 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gpr68-202ENSMUST00000110065 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms