Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm11701-201ENSMUST00000121277 1142 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms