Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm42731-201ENSMUST00000201839 1641 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Zfp133-ps-201ENSMUST00000119058 1802 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Creb3l4-202ENSMUST00000107369 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Rhox4a-201ENSMUST00000115194 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm12254-201ENSMUST00000134617 471 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm21963-201ENSMUST00000179519 330 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm26594-201ENSMUST00000180383 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Zfp572-201ENSMUST00000183674 1098 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm35299-201ENSMUST00000195865 421 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm5130-201ENSMUST00000210233 959 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Olfr1384-201ENSMUST00000060434 1034 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Ribc1-201ENSMUST00000026288 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Mapk1ip1-202ENSMUST00000118810 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Fcrla-203ENSMUST00000159171 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm44907-201ENSMUST00000207423 1633 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 9530059O14Rik-204ENSMUST00000215759 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 P2rx7-201ENSMUST00000031425 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 CT009713.3-201ENSMUST00000224987 1565 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm44933-201ENSMUST00000208637 1987 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Shf-205ENSMUST00000121237 882 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Smt3h2-ps2-201ENSMUST00000122370 288 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm13554-201ENSMUST00000137349 477 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 D430040D24Rik-201ENSMUST00000149224 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm20474-201ENSMUST00000180089 596 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm27200-201ENSMUST00000184626 657 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Pf4-203ENSMUST00000202625 411 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Crip1-201ENSMUST00000006523 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Papss1-206ENSMUST00000200527 2811 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm5174-201ENSMUST00000171131 1423 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms