Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Ccl19-201ENSMUST00000102957 745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Igkv4-55-201ENSMUST00000103359 379 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm12452-201ENSMUST00000117128 331 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm6341-201ENSMUST00000119683 411 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Rpl10-ps6-201ENSMUST00000121321 642 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm15895-201ENSMUST00000157018 731 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Prdx5-204ENSMUST00000173091 501 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm28053-203ENSMUST00000204408 351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm34358-201ENSMUST00000204585 665 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Rpl10-ps5-201ENSMUST00000212707 642 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Ryk-ps1-201ENSMUST00000219713 235 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm3379-201ENSMUST00000222259 642 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Olfr1229-201ENSMUST00000099788 1019 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 AC151903.1-201ENSMUST00000226677 1423 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Il18bp-203ENSMUST00000209844 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Poteg-201ENSMUST00000081321 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm13498-201ENSMUST00000119159 2166 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Cep19-203ENSMUST00000169186 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Ctsll3-201ENSMUST00000043754 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Mir704-201ENSMUST00000102106 77 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 2310026L22Rik-201ENSMUST00000146658 400 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Pou1f1-203ENSMUST00000176038 1174 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 5730420D15Rik-201ENSMUST00000181781 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm29372-201ENSMUST00000191416 364 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Rpl19-ps2-201ENSMUST00000219540 590 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Ly6g5b-201ENSMUST00000062657 1046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Camk2g-202ENSMUST00000080440 3604 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Mepe-201ENSMUST00000066207 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm24556-201ENSMUST00000104547 130 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Mrps18b-202ENSMUST00000113782 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Hmox2-203ENSMUST00000120232 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm12376-201ENSMUST00000120538 607 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm6298-201ENSMUST00000122262 981 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Myl12a-202ENSMUST00000123686 804 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 2900076A07Rik-201ENSMUST00000180385 914 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm36569-201ENSMUST00000195082 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm5043-201ENSMUST00000202103 820 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Tmem147-207ENSMUST00000209065 727 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm7210-201ENSMUST00000209309 1067 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm32567-201ENSMUST00000211244 682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Rnf212b-201ENSMUST00000218311 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 1700109K24Rik-202ENSMUST00000227532 1030 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Cib3-201ENSMUST00000098630 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Snx7-205ENSMUST00000198499 1314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm15550-201ENSMUST00000120824 1748 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Zfp74-204ENSMUST00000108212 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm45440-201ENSMUST00000209826 1655 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Sox2ot-211ENSMUST00000197977 2970 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm14182-201ENSMUST00000119334 210 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm13450-201ENSMUST00000121107 167 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Alg13-203ENSMUST00000123710 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Ccdc28a-205ENSMUST00000174592 882 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm27149-201ENSMUST00000184716 1266 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 4930573I07Rik-202ENSMUST00000199120 413 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm35665-201ENSMUST00000206742 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm18780-201ENSMUST00000209594 574 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 AC159244.2-201ENSMUST00000222051 220 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 CT030657.4-201ENSMUST00000222177 744 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms