Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms