Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Pms2-209ENSMUST00000148011 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Dcx-204ENSMUST00000112856 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Spata17-201ENSMUST00000027908 1303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gsdmc3-203ENSMUST00000190682 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Cpsf3-211ENSMUST00000222968 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Itga10-201ENSMUST00000029744 5044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Parp3-201ENSMUST00000067218 2962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Ak3l2-ps-201ENSMUST00000120282 672 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm12035-201ENSMUST00000121890 623 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 1700001J04Rik-202ENSMUST00000154037 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm37141-201ENSMUST00000191938 422 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Upb1-201ENSMUST00000039925 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Eng-205ENSMUST00000167841 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Harbi1-201ENSMUST00000090608 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Slc36a2-201ENSMUST00000039305 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Fgf14-201ENSMUST00000026631 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Prdx6-202ENSMUST00000071718 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Kcne1-201ENSMUST00000051705 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Olfr804-202ENSMUST00000213331 5737 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm12645-201ENSMUST00000117297 275 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm7516-201ENSMUST00000186198 706 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 1700012J15Rik-201ENSMUST00000203458 471 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Nat8f5-201ENSMUST00000032074 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Olfr709-ps1-201ENSMUST00000072368 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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