Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Gm38348-201ENSMUST00000191718 2273 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Ccdc83-201ENSMUST00000040413 1546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Plac9b-201ENSMUST00000100809 388 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 8430423G03Rik-201ENSMUST00000110507 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm12047-201ENSMUST00000117561 944 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm3880-201ENSMUST00000122154 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Banf2os-201ENSMUST00000124061 771 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 6330418K02Rik-202ENSMUST00000125662 1267 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm30301-201ENSMUST00000199474 652 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Supt4a-201ENSMUST00000093955 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Dpep2-202ENSMUST00000117555 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm13758-201ENSMUST00000118699 743 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm14153-201ENSMUST00000119923 1139 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm12862-201ENSMUST00000150754 472 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 CR974487.1-201ENSMUST00000220984 413 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 AC163646.3-202ENSMUST00000228685 691 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Tff3-201ENSMUST00000024827 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Prpf18-204ENSMUST00000152362 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm28453-201ENSMUST00000185556 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Serpina5-201ENSMUST00000021495 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Cd14-201ENSMUST00000061829 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm13071-201ENSMUST00000122237 376 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Plxna4os3-201ENSMUST00000127668 269 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Tnni1-208ENSMUST00000154463 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Rbp2-204ENSMUST00000189446 803 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm7565-201ENSMUST00000203611 623 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms