Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Bank1-205ENSMUST00000198206 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 C230053D17Rik-201ENSMUST00000214451 2246 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp2c55-201ENSMUST00000025966 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Cldn34c1-202ENSMUST00000113348 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5893-201ENSMUST00000135286 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr721-ps1-201ENSMUST00000165291 975 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Gtf3c6Q9D8P7 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
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Gtf3c6Q9D8P7 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Gtf3c6Q9D8P7 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Gtf3c6Q9D8P7 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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Gtf3c6Q9D8P7 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Etos1-201ENSMUST00000057134 2015 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Chrm1-201ENSMUST00000035444 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29326-201ENSMUST00000185541 2451 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16025-202ENSMUST00000161923 2425 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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