Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm10318-201ENSMUST00000186874 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm20281-201ENSMUST00000188225 267 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm37963-201ENSMUST00000195351 613 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm44658-201ENSMUST00000207965 637 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Apoc3-201ENSMUST00000034586 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Cenph-201ENSMUST00000075550 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm39312-201ENSMUST00000213586 2195 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Crisp4-203ENSMUST00000115344 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Rpl7a-ps12-201ENSMUST00000120384 794 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm13071-201ENSMUST00000122237 376 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm11686-201ENSMUST00000122397 333 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Rps9-205ENSMUST00000126562 896 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm26609-201ENSMUST00000181302 852 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 1810059H22Rik-202ENSMUST00000203662 546 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm18670-201ENSMUST00000218712 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 AC165249.1-203ENSMUST00000219976 392 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Dcstamp-205ENSMUST00000228556 1684 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp54Q8BL06 Gm15788-202ENSMUST00000140087 751 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 4933439K11Rik-202ENSMUST00000140307 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 2310026L22Rik-201ENSMUST00000146658 400 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp54Q8BL06 Eif3k-202ENSMUST00000207683 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm18857-201ENSMUST00000210421 901 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp54Q8BL06 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp54Q8BL06 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp54Q8BL06 Cyp2c44-201ENSMUST00000026211 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Hsd17b6-202ENSMUST00000219183 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Drc3-201ENSMUST00000070805 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Cox4i2-202ENSMUST00000109821 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Katnal2-203ENSMUST00000123650 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm7799-201ENSMUST00000133080 476 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 1700018A04Rik-203ENSMUST00000150418 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 1700034B16Rik-201ENSMUST00000180957 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm7583-201ENSMUST00000182941 1005 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm38301-201ENSMUST00000195573 543 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Platr25-206ENSMUST00000222303 1171 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm6960-201ENSMUST00000051629 639 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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