Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gtf2i-223ENSMUST00000174513 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Mid1-204ENSMUST00000112104 3860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Fignl1-207ENSMUST00000171938 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Phka2-204ENSMUST00000112380 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Fubp1-220ENSMUST00000200524 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Dpy19l2-201ENSMUST00000133010 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 5430416N02Rik-201ENSMUST00000180779 3486 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm26809-201ENSMUST00000180863 2981 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 C230057M02Rik-201ENSMUST00000212334 3306 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm37302-201ENSMUST00000192958 2998 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm45336-201ENSMUST00000210010 3230 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Xab2-201ENSMUST00000019614 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 AC124426.1-201ENSMUST00000220871 2707 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gsdme-203ENSMUST00000165099 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Kcnj5-202ENSMUST00000214223 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Il6st-210ENSMUST00000184949 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Xlr3a-201ENSMUST00000074619 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Tdp1-207ENSMUST00000153627 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Mbd1-201ENSMUST00000097530 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Hspd1-ps4-201ENSMUST00000121815 1668 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gmeb2-201ENSMUST00000049032 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms