Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm10093-201ENSMUST00000079363 1977 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm15032-201ENSMUST00000118547 411 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm11701-201ENSMUST00000121277 1142 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Rnasek-203ENSMUST00000141880 465 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm10053-201ENSMUST00000073080 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm5310-201ENSMUST00000197861 1511 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Hdac9-208ENSMUST00000211107 1683 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm20953-201ENSMUST00000216399 2614 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Pde9a-206ENSMUST00000134525 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Cfap100-201ENSMUST00000062750 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Samsn1-201ENSMUST00000114239 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Masp2-202ENSMUST00000105701 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm5905-201ENSMUST00000211731 580 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Pde4d-202ENSMUST00000079975 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 St6galnac2-206ENSMUST00000144398 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms