Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Gtpbp6Q3U6U5 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Gtpbp6Q3U6U5 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Gtpbp6Q3U6U5 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Gtpbp6Q3U6U5 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Gtpbp6Q3U6U5 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Gtpbp6Q3U6U5 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14795-201ENSMUST00000118461 471 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.6 ms