Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm4880-201ENSMUST00000207645 1696 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Cd247-202ENSMUST00000027849 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm36211-201ENSMUST00000198171 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm43737-201ENSMUST00000199915 2740 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm15132-201ENSMUST00000118581 652 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm8864-201ENSMUST00000118653 1010 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm20455-201ENSMUST00000174100 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm7251-201ENSMUST00000182661 1009 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Tmbim7-201ENSMUST00000014673 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Bpifb2-201ENSMUST00000028983 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Rxfp2-202ENSMUST00000110496 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Ttll7-203ENSMUST00000106134 2664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Wdr20rt-202ENSMUST00000221658 1570 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm25723-201ENSMUST00000104530 126 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Rplp1-ps1-201ENSMUST00000119410 345 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm5259-201ENSMUST00000191231 800 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm44709-201ENSMUST00000207649 448 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 AC134439.3-201ENSMUST00000223486 851 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 AC130217.1-201ENSMUST00000224146 909 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 AC156016.4-201ENSMUST00000227470 647 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Tmem89-201ENSMUST00000026744 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Zdhhc9-201ENSMUST00000037960 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm4883-201ENSMUST00000085702 528 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Supt4a-201ENSMUST00000093955 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Sfmbt2-202ENSMUST00000114861 1813 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Cfap100-201ENSMUST00000062750 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Cyp2d9-201ENSMUST00000089129 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Fcrl1-206ENSMUST00000194786 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm3712-201ENSMUST00000118523 2071 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Mettl8-204ENSMUST00000112186 2347 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms