Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm39312-201ENSMUST00000213586 2195 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm13975-201ENSMUST00000119253 782 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm14323-201ENSMUST00000122418 627 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Rbm4-201ENSMUST00000164209 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm6665-201ENSMUST00000165131 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm7583-201ENSMUST00000182941 1005 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm43628-201ENSMUST00000197871 1187 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm35298-201ENSMUST00000222719 430 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Crygc-201ENSMUST00000027089 783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Cdca8-201ENSMUST00000030690 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Clec1b-201ENSMUST00000032262 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Cd1d2-201ENSMUST00000041920 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cux1P53564 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Olfr1491-204ENSMUST00000216366 1726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Zfp74-204ENSMUST00000108212 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Olfr62-201ENSMUST00000102666 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Cyp2j15-ps-201ENSMUST00000122267 686 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm22669-201ENSMUST00000158723 318 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20924-201ENSMUST00000177663 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20816-201ENSMUST00000177765 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20909-201ENSMUST00000178234 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20825-202ENSMUST00000178396 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20852-201ENSMUST00000178761 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20867-201ENSMUST00000178900 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21443-201ENSMUST00000179070 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20747-201ENSMUST00000179137 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21394-201ENSMUST00000179523 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21783-201ENSMUST00000179570 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21812-201ENSMUST00000179590 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21721-201ENSMUST00000179595 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20809-201ENSMUST00000179663 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21118-201ENSMUST00000180179 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20806-201ENSMUST00000180324 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20909-202ENSMUST00000181205 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20907-201ENSMUST00000185201 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cux1P53564 Gm21785-201ENSMUST00000185440 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21808-201ENSMUST00000185495 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20898-201ENSMUST00000185598 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20800-201ENSMUST00000185634 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20902-201ENSMUST00000185643 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21268-201ENSMUST00000185646 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21257-201ENSMUST00000185655 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21733-201ENSMUST00000185670 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm29075-201ENSMUST00000185717 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20889-201ENSMUST00000185749 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm28273-201ENSMUST00000185811 695 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20799-201ENSMUST00000185833 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21160-201ENSMUST00000185838 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21741-201ENSMUST00000185883 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21922-201ENSMUST00000185911 678 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21275-201ENSMUST00000185958 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20847-201ENSMUST00000186066 678 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20927-201ENSMUST00000186168 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21810-201ENSMUST00000186188 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21683-201ENSMUST00000186201 678 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20805-201ENSMUST00000186299 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm28436-201ENSMUST00000186307 698 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm28480-201ENSMUST00000186383 453 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21912-201ENSMUST00000186393 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20881-201ENSMUST00000186397 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21832-201ENSMUST00000186439 691 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20922-201ENSMUST00000186497 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm28099-201ENSMUST00000186511 699 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21308-201ENSMUST00000186571 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21271-201ENSMUST00000186689 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21344-201ENSMUST00000186754 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21282-201ENSMUST00000186766 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21462-201ENSMUST00000186803 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20861-201ENSMUST00000186824 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21330-201ENSMUST00000186881 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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