Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 9530026P05Rik-201ENSMUST00000181121 2142 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Sncaip-201ENSMUST00000025413 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm6881-201ENSMUST00000121811 833 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm6353-201ENSMUST00000223234 1051 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Arid5a-202ENSMUST00000115029 4329 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Proser3-201ENSMUST00000062708 1905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Adamtsl4-201ENSMUST00000015994 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Tmem131l-203ENSMUST00000192095 4774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 AU019990-202ENSMUST00000143964 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Ptpn7-201ENSMUST00000049449 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm28578-203ENSMUST00000189196 1470 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Tcaf1-201ENSMUST00000045054 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Tmem63a-205ENSMUST00000161523 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Mtbp-201ENSMUST00000022998 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Rian-213ENSMUST00000182981 1219 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm19121-201ENSMUST00000215720 1022 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Olfr1189-201ENSMUST00000090700 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Fbxo38-201ENSMUST00000048688 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Acbd5-212ENSMUST00000227663 4566 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Alppl2-201ENSMUST00000027455 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm5099-201ENSMUST00000194892 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Eftud2-212ENSMUST00000173679 2889 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Zfp264-202ENSMUST00000208781 2801 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms