Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Pds5a-201ENSMUST00000031104 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Trim69-201ENSMUST00000036089 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Prrg3-201ENSMUST00000048790 5931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Bcl9-207ENSMUST00000166341 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Phka2-204ENSMUST00000112380 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Sall4-203ENSMUST00000103074 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Copa-206ENSMUST00000135192 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Ik-201ENSMUST00000007042 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Napepld-202ENSMUST00000115217 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 H2-Eb2-201ENSMUST00000050325 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Aplp2-201ENSMUST00000072634 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Fam122b-201ENSMUST00000071023 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Syne1-201ENSMUST00000041639 6990 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm15482-201ENSMUST00000152691 4529 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Olfr287-204ENSMUST00000170618 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
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