Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Rgs8-205ENSMUST00000111815 765 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm13898-201ENSMUST00000141865 610 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm11521-201ENSMUST00000143302 329 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Mir6396-201ENSMUST00000183603 111 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm43450-201ENSMUST00000202611 632 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm28053-203ENSMUST00000204408 351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm18030-201ENSMUST00000222163 731 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gpr151-201ENSMUST00000054738 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Ifna6-201ENSMUST00000105146 570 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm15132-201ENSMUST00000118581 652 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Zfp961-204ENSMUST00000136516 601 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm11789-205ENSMUST00000148579 649 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Ifna11-201ENSMUST00000170428 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Ccdc28a-205ENSMUST00000174592 882 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Fam47e-205ENSMUST00000175974 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm6317-201ENSMUST00000183159 1000 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm9273-201ENSMUST00000200606 715 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Ifna1-201ENSMUST00000094972 570 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Syngap1F6SEU4 Gm37145-201ENSMUST00000193540 2756 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms