Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Osgep-202ENSMUST00000159292 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Daam2-201ENSMUST00000057610 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Ms4a6c-201ENSMUST00000165310 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm45769-201ENSMUST00000204588 1828 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Ovgp1-201ENSMUST00000000573 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Amer3-201ENSMUST00000052670 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm45867-201ENSMUST00000208201 2317 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Exosc10-201ENSMUST00000017408 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gpm6b-205ENSMUST00000112227 3294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms