Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr779-202ENSMUST00000222301 929 ntAPPRIS P5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Padi3-201ENSMUST00000026377 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Myo6-212ENSMUST00000184480 4139 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Cnga3-201ENSMUST00000027288 3554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Csnk1d-202ENSMUST00000070575 3500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc2-201ENSMUST00000035076 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 AC120347.1-201ENSMUST00000223326 1639 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43792-201ENSMUST00000202492 2210 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Apol7b-201ENSMUST00000089469 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Ncoa6-202ENSMUST00000109669 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Fam110c-201ENSMUST00000041133 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Nsdhl-201ENSMUST00000033715 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43670-201ENSMUST00000199047 1767 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms