Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 CT025639.2-202ENSMUST00000225298 1630 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn22Q9D7U6 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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