Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Rxfp2-202ENSMUST00000110496 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Ciao1Q99KN2 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Ciao1Q99KN2 Gm18894-201ENSMUST00000198794 694 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Ciao1Q99KN2 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Ciao1Q99KN2 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Drc3-201ENSMUST00000070805 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Ciao1Q99KN2 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Ciao1Q99KN2 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Ciao1Q99KN2 Pttg1ip-208ENSMUST00000162943 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Ciao1Q99KN2 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Ciao1Q99KN2 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Pax5-202ENSMUST00000102932 1460 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Ttll2-201ENSMUST00000115747 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ciao1Q99KN2 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ciao1Q99KN2 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ciao1Q99KN2 Vgll3-202ENSMUST00000227997 1383 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ciao1Q99KN2 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ciao1Q99KN2 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ciao1Q99KN2 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ciao1Q99KN2 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ciao1Q99KN2 Gm24981-201ENSMUST00000104459 132 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ciao1Q99KN2 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ciao1Q99KN2 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ciao1Q99KN2 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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