Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCS6

Pabpn1, Polyadenylate-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpn1Q8CCS6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Mir467f-201ENSMUST00000116923 120 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm12875-201ENSMUST00000118745 344 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm12361-201ENSMUST00000119806 1044 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Snhg17-208ENSMUST00000154242 346 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm25455-201ENSMUST00000157946 325 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm26964-201ENSMUST00000182516 832 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 1700041I07Rik-201ENSMUST00000197536 435 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm43957-201ENSMUST00000203606 362 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Rpl18a-ps4-201ENSMUST00000206176 536 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm6993-201ENSMUST00000219110 210 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 AC154766.1-201ENSMUST00000226550 936 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Reg4-201ENSMUST00000029469 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm24145-201ENSMUST00000082631 163 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 9630028H03Rik-202ENSMUST00000153402 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Wdr45-202ENSMUST00000115687 1299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Olfr1343-ps1-201ENSMUST00000117414 914 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Samd13-204ENSMUST00000147113 729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 1700031F10Rik-202ENSMUST00000156018 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Pkib-204ENSMUST00000175852 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm8907-201ENSMUST00000182240 1003 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm8976-201ENSMUST00000187136 703 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm5951-201ENSMUST00000220283 504 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Lyg1-201ENSMUST00000027254 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Copg1-201ENSMUST00000049966 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Endov-201ENSMUST00000064513 954 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Lyrm7-205ENSMUST00000144164 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 AC159819.3-201ENSMUST00000216940 1837 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Ugt1a9-201ENSMUST00000073772 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm12700-201ENSMUST00000118145 457 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm11668-201ENSMUST00000119655 701 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 1810019D21Rik-203ENSMUST00000145343 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm7678-201ENSMUST00000181879 943 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm28199-201ENSMUST00000187127 619 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 250 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm28244-201ENSMUST00000189342 356 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm37144-201ENSMUST00000195445 1150 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm44131-201ENSMUST00000203036 394 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 1700063H04Rik-201ENSMUST00000043553 817 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm22054-201ENSMUST00000083395 155 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Olfr132-201ENSMUST00000087128 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm19337-201ENSMUST00000218100 1584 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Zfp69-202ENSMUST00000106281 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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