Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 D430042O09Rik-203ENSMUST00000124223 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Zfp709-203ENSMUST00000188685 7186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Fgd3-202ENSMUST00000110086 2628 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Mc3r-201ENSMUST00000038532 2623 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Stk36-202ENSMUST00000087186 4065 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Abcc8-201ENSMUST00000033123 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Celf2-211ENSMUST00000142941 2338 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Lsm6-203ENSMUST00000130325 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Sox2ot-211ENSMUST00000197977 2970 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Zfp451-202ENSMUST00000044455 11876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Cd300a-201ENSMUST00000045151 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Tia1-202ENSMUST00000095753 4477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Csf3r-201ENSMUST00000030673 3160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm5114-201ENSMUST00000108017 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Kif28-203ENSMUST00000221136 3538 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 C6-204ENSMUST00000162585 2876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Kcnh6-201ENSMUST00000001965 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Styk1-201ENSMUST00000049150 3380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm43910-201ENSMUST00000204561 3241 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Prpf40a-201ENSMUST00000076313 7374 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Ssb-206ENSMUST00000166411 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Apol11b-201ENSMUST00000166623 2057 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Unc45b-205ENSMUST00000164945 3555 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm43457-201ENSMUST00000200867 2409 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 C2-205ENSMUST00000148431 1946 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 St5-202ENSMUST00000079282 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Kcnip4-204ENSMUST00000166924 2257 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Stxbp5l-203ENSMUST00000114780 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Scfd2-208ENSMUST00000151474 3834 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Olfr209-203ENSMUST00000208875 1194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm2253-201ENSMUST00000211775 414 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Olfr376-202ENSMUST00000120401 3342 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Upp2-203ENSMUST00000102755 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Heatr5b-201ENSMUST00000097281 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Mgat4a-202ENSMUST00000143636 1802 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gpr85-202ENSMUST00000115491 2165 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Dpp4-201ENSMUST00000047812 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Acox2-201ENSMUST00000022271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Vash2-202ENSMUST00000166139 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Kif1a-204ENSMUST00000171796 8206 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm13128-201ENSMUST00000105751 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Ptgr1-201ENSMUST00000030069 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Cdk20-201ENSMUST00000021939 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef3-201ENSMUST00000049206 3585 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Pms1-201ENSMUST00000027267 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Zc3h7a-201ENSMUST00000037633 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Ano1-203ENSMUST00000121758 4552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Kpna6-202ENSMUST00000102590 5710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Cdh18-203ENSMUST00000164787 2744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Pde2a-212ENSMUST00000211368 3885 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Akt2-204ENSMUST00000108343 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Phf21a-208ENSMUST00000111294 3710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Lin7a-202ENSMUST00000105280 1634 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1357-201ENSMUST00000095473 1826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm6878-201ENSMUST00000100448 2018 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Fam221b-201ENSMUST00000056474 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 1700017G19Rik-201ENSMUST00000035860 2437 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Snrpd3-201ENSMUST00000020397 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Baiap3-201ENSMUST00000169109 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm14326-203ENSMUST00000108932 888 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms