Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Eif3c-201ENSMUST00000032992 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Ccdc87-201ENSMUST00000088653 3163 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Wiz-203ENSMUST00000087703 4175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Entpd1-204ENSMUST00000134063 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Cd247-206ENSMUST00000161971 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Atcay-201ENSMUST00000047408 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Adamts4-201ENSMUST00000111314 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Plscr2-205ENSMUST00000180154 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Actn2-203ENSMUST00000168193 2920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Slc35f6-201ENSMUST00000062962 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Lrrcc1-202ENSMUST00000108370 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm12592-201ENSMUST00000155332 2954 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Acmsd-201ENSMUST00000038006 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Pigq-202ENSMUST00000097368 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms