Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Kng1-202ENSMUST00000039492 1985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Igkv3-9-201ENSMUST00000103398 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Polr1c-203ENSMUST00000124655 829 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Mir6360-201ENSMUST00000184278 126 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Zfp568-204ENSMUST00000177931 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Drc3-201ENSMUST00000070805 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Ptgr1-201ENSMUST00000030069 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 CN725425-201ENSMUST00000109284 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 A430093F15Rik-201ENSMUST00000087947 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Car13-201ENSMUST00000029071 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Pcdh15-229ENSMUST00000155701 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Blnk-201ENSMUST00000054769 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm37976-201ENSMUST00000193827 345 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm18596-201ENSMUST00000218133 843 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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