Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q3U6N9 AC130671.3-201ENSMUST00000227393 1897 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q3U6N9 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Igkv3-9-201ENSMUST00000103398 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm24471-201ENSMUST00000104485 131 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Polr1c-203ENSMUST00000124655 829 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Rps18-206ENSMUST00000174609 527 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Mir6360-201ENSMUST00000184278 126 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 1700052H01Rik-201ENSMUST00000196142 717 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm3889-201ENSMUST00000212467 612 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 AC130217.1-201ENSMUST00000224146 909 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm15032-201ENSMUST00000118547 411 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm8083-201ENSMUST00000203976 475 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Xlr4b-201ENSMUST00000069077 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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