Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm5310-201ENSMUST00000197861 1511 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm28578-203ENSMUST00000189196 1470 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm13498-201ENSMUST00000119159 2166 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm11427-201ENSMUST00000117952 1696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Arg2-201ENSMUST00000021550 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Wdr95-207ENSMUST00000202902 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Vwa3b-205ENSMUST00000162449 1360 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm17644-201ENSMUST00000181272 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm14853-201ENSMUST00000116081 549 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm12420-201ENSMUST00000119869 1048 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm3880-201ENSMUST00000122154 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm15472-201ENSMUST00000141652 847 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm24352-201ENSMUST00000158966 125 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Rps18-206ENSMUST00000174609 527 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm24368-201ENSMUST00000175388 106 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm6967-201ENSMUST00000182599 1007 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm3889-201ENSMUST00000212467 612 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 AC100406.1-201ENSMUST00000217305 480 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 AC163646.3-202ENSMUST00000228685 691 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Ptgr2-201ENSMUST00000123614 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Fam13c-203ENSMUST00000173042 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Ttll2-201ENSMUST00000115747 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 D030068K23Rik-203ENSMUST00000181098 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Cyp2b13-201ENSMUST00000005669 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Maats1os-201ENSMUST00000133496 326 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm15650-201ENSMUST00000135451 770 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm45846-201ENSMUST00000211170 446 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 AC161877.1-201ENSMUST00000227736 699 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm14858-201ENSMUST00000138614 1758 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Il7-204ENSMUST00000194184 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm45728-201ENSMUST00000211475 2979 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Zfp74-204ENSMUST00000108212 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm31763-202ENSMUST00000218205 1724 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 4833420G17Rik-201ENSMUST00000026519 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms