Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx2P80206 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx2P80206 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx2P80206 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx2P80206 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx2P80206 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx2P80206 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Fhad1-203ENSMUST00000105780 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx2P80206 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx2P80206 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Zc3h7a-201ENSMUST00000037633 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm9531-201ENSMUST00000055820 638 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Mrps14-202ENSMUST00000097193 787 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 L1cam-203ENSMUST00000114430 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms