Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snap25P60879 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Snap25P60879 AC149294.3-201ENSMUST00000226888 732 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snap25P60879 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Gm15015-201ENSMUST00000135491 636 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Gm15020-201ENSMUST00000147142 636 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 CN725425-201ENSMUST00000109284 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms