Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Slc18a2-201ENSMUST00000026084 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Atxn7l1-212ENSMUST00000146040 2973 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Frrs1-201ENSMUST00000040260 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm26947-201ENSMUST00000182497 2929 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Wdr78-202ENSMUST00000036557 3479 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Rdh16f1-201ENSMUST00000128247 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm37798-201ENSMUST00000193026 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Platr9-202ENSMUST00000149572 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps97-201ENSMUST00000222427 1970 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 D030018L15Rik-202ENSMUST00000139808 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Ccdc33-210ENSMUST00000215944 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Mef2c-218ENSMUST00000198199 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm26751-201ENSMUST00000181218 4245 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Kdm4a-201ENSMUST00000050288 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Sh3bp1P55194 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Sh3bp1P55194 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 AC134898.1-201ENSMUST00000223738 1836 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm14372-201ENSMUST00000125355 2193 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Slc6a16-203ENSMUST00000213347 2865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 AW146154-201ENSMUST00000098509 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Fgd1-202ENSMUST00000112685 3240 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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