Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm20274-201ENSMUST00000206967 584 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm34237-201ENSMUST00000220575 1257 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms