Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm44629-201ENSMUST00000206951 1840 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Zfp446-201ENSMUST00000045810 4615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gcm1-201ENSMUST00000024104 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Atcay-201ENSMUST00000047408 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 1700030K09Rik-201ENSMUST00000064853 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Egf-201ENSMUST00000029653 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm4810-201ENSMUST00000177721 1607 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Tbx4-202ENSMUST00000108045 2959 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Sytl4-202ENSMUST00000113294 2958 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Tdp1-207ENSMUST00000153627 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Atg9a-201ENSMUST00000040689 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Dock7-201ENSMUST00000030286 7127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Abr-204ENSMUST00000108407 4811 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm40289-201ENSMUST00000201470 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Trpm5-201ENSMUST00000009390 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Zbtb8b-202ENSMUST00000106046 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Cngb1-204ENSMUST00000121162 3336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Zbtb37-205ENSMUST00000171748 2141 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Napepld-202ENSMUST00000115217 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Rasgrp4-201ENSMUST00000032811 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Rasgrp4-202ENSMUST00000094617 4617 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm10093-201ENSMUST00000079363 1977 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Lmbrd1-206ENSMUST00000191471 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Sgk2-202ENSMUST00000117123 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Cish-201ENSMUST00000085102 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Cyp2e1-201ENSMUST00000026552 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Pex7-201ENSMUST00000020182 8099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Mtor-202ENSMUST00000103221 8564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Cep95-202ENSMUST00000103068 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Abcc4-202ENSMUST00000166646 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 AC153512.3-201ENSMUST00000220426 662 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Sulf2-202ENSMUST00000109249 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Cacna1c-206ENSMUST00000185345 6579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Fes-201ENSMUST00000080932 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Has3-201ENSMUST00000034385 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Olfr73-202ENSMUST00000129056 3048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Ralgps1-204ENSMUST00000113165 6192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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