Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp4P35123 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp4P35123 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp4P35123 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Zfp568-204ENSMUST00000177931 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Fbxl12-206ENSMUST00000148631 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Stoml3-201ENSMUST00000029307 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 1810034E14Rik-201ENSMUST00000181403 1805 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Nek5-201ENSMUST00000169834 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Gm7932-202ENSMUST00000205047 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Pex5l-204ENSMUST00000108224 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Nrxn1-225ENSMUST00000197268 2280 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Npnt-205ENSMUST00000117456 3383 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp4P35123 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp4P35123 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms