Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Prrg3-201ENSMUST00000048790 5931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pou3f1P21952 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Pou3f1P21952 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms